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明末，人们迷信修仙炼丹拒绝求医，中医式微。少年医者李子明机缘巧合之下从一本破旧的《本草纲目》中召唤出药灵——冬葵仙子。她恳请世间唯一能和曾经的李时珍一样与药灵对话的李子明帮助药灵们收集因事故四散的《本草纲目》残页，拯救草药精灵们的世界，同时将《本草纲目》中记载的资料流传下来，将中医发扬光大。李子明医者仁心，不忍拒绝，从此踏上旅程。在一系列遭遇和邂逅中不断成长，收集残页的同时也与药灵们结下深厚羁绊。

死后五百年，还被人们铭记的人，他们的灵魂便可以成为“灵体”。 根据现代人的印象，呈现出与生前的人形不同的形态。如今，不少历史上的著名人物成为“灵体”，在新的时代，述写新的传奇。作品独创性的提出“魂”与“灵体”之间关系的概念——一直被人们记住的历史人物的“魂”最后幻化成了“灵体”寄宿在了后来的一代又一代的人身上，并永不停息的持续着“他们”之间的战争，此所谓“魂战纪”。

一代天才玄脉受损成为废物，家族摒弃，世人嘲笑，甚至新婚之夜遭人毒害……玄天至宝，轮回镜现，逆天改命，重启人生，带着仇恨与遗憾，誓要登顶力量的巅峰！

女主阳萝目睹母亲被吸入一本天书，为了寻回母亲，阳萝开始四处收集天书，并在“藏书阁”昴和男主人公习语的陪伴下，克服了种种困难。随着收集的天书越多，阳萝发现母亲竟然是天书里面的人物，并与身为人类的父亲产生了爱的结晶，生下了自己。阳萝有一半天书血统的事瞬间引起了很多藏书阁的注意，并对阳萝采取了回收行动。于是阳萝一边应对这些藏书阁，一边加快速度收集天书。